> нужно контейнер вывести не через тот который основной

выводи, разрешаем
а если серьёзно - позовите админа, за деньги, вы девляпсы не доросли ещё до понимания маршрутизации, в том числе PBR, пакетных фильтров, натов итд итп
вы даже не доросли до того чтоб вопрос нормально задать, вот окуда нам знать что у вас там с сетью на хосте и на контэйнерах накручено? по предоставленным тобой данным нормальный ответ даже гадалки дать не смогут  

> токая ситуация товарищи, нужна ваша помощь
> есть docker контейнер и несколько внешних ip
> нужно контейнер вывести не через тот который основной
> заранее спасибо

docker по default формирует правила masq, а раз masq -- значит snat происходит согласно правила маршрутизации. Соответственно, еесли в рутинг будет прописаны соответствующая маршрутизация то и работать будет соответственно.
В mangle маркаем пакета по входящему интерфейсу, в rule прописываем таблицу, в таблице указываем default маршрут.
Ну, или тупо вместо default masq прописываем -j snat