>1. какую UNIX-подобную ОС выбрать для десктопа; почему не FreeBSD Потому что объективно Linux выигрывает у *BSD и Solaris на десктопе. Больше поддерживается железа, больший набор программ, больший выбор дистрибутивов под различные вкусы.
>2. существует-ли текстовый редактор с подсветкой синтаксиса, который редактирует удаленные файлы на
>локальной машине. Тоесть открываю на своем компе файл, находящийся на сервере,
>редактирую его, а когда сохраняю - он автоматом заливается на сервер.
Какой ужас, никогда так не делайте, это в корне неверно и в один день может привести к большим проблемам.
>3. какие трудности ждут меня
Зависит от инерции мышления, совместимости с железом и немного от выбора дистра. В целом чем лучше вы знаете windows, тем тяжелее будет переход ибо придется ломать множество сложившихся стереотипов.