>То есть нужно всех системных пользователей перенести в MySQL, с сохранением старых
>паролей, для плавного перехода(300 человек обежать и сменить им всем пароли
>- импосибл). Поэтому и был задан такой вопрос.

Можно также избежать правки исходников, при соблюдении определенного количества "если"

Если у вас пароли по сети гуляют plainтекстом, и под плавностью перехода также понимается достаточно большой промежуток времени, можете их слушать локально tcpdump'ом на почтовом сервере. За месяц все нужные пароли соберете, а остальными можно смело пренебречь.

P.S. Раньше видел port, который являлся надстройкой над tcpdump специально для прослушивания POP3 паролей, сейчас не нашел.