> Здравствуйте.
> Обновил debian с 5 до 6 версии, пропал графический пакетный менеджер. Тоесть
> Система - Администрирование, а там нет ничего про пакеты вообще :(
> Может кто-то пояснить почему так произошло и как это исправить? :) Или
> хотябы как называется эта программа, чтобы запустить из консоли.

/usr/sbin/synaptic
если окажется что его нет, проверь вывод
dpkg --get-selections |grep synaptic
должно получиться
synaptic                                        install
если нет, должно помочь
aptitude install synaptic
или
sudo aptitude install synaptic
не от root'а

P.S. а каким образом обновил?