> Надо построить графики по таблице:

Тривиально же, нет?

cat > testdata.txt << EOF
#X    Y1        Y2        Y3
0    0,4594    0,2202    -0,0144
10    0,4614    0,2264    -0,0187
20    0,4608    0,2253    -0,0163
30    0,4619    0,2192    -0,0122
40    0,4606    0,2227    -0,0093
EOF
sed -ri 's/,/./g' testdata.txt
gnuplot -e "\
  set terminal jpeg; \
  plot 'testdata.txt' using 1:2 title 'Y1', \
       'testdata.txt' using 1:3 title 'Y2', \
       'testdata.txt' using 1:4 title 'Y3' \
  " >> testdata.jpg
shotwell testdata.jpg

> Не могу найти в мануале и сайтах, посвященных программе два момента:
> 1. Синтаксис построения графиков из таблиц.
> 2. Построение нескольких графиков X, Y1,Y2,Y3 на одном листе.

http://people.duke.edu/~hpgavin/gnuplot.html (3.2 Plotting Data)

Ещё подглядывал в http://zenonharley.com/gnuplot/cli/2015/06/29/graphing-data-...

По обоим ссылкам ещё много примеров.