Можно код под отладчиком/эмулятором/симулятором запускать. В зависимости от требуемой точности может хватить QEmu, а может понадобиться к обратиться к Bochs, AMD SimNow или вообще шкафу с FPGA'шками.

Можно проц подключить не напрямую, а через ICE (in-circuit emulator), но это уже давно практически вымерло, слишком быстрые интерфейсы.

Можно проц контролировать через отладочный интерфейс: у большинства это JTAG (а на микроконтроллерах можно встретить аналог попроще: SWD или что-то в разной степени проприетарное), у сколь-нибудь свежих Intel это более быстрый и очень проприетарный XDP (плюс, иногда есть поддержка отладки через выделенный USB порт, но там нужна и материнка не абы какая, и по пути всё равно нужен отладочный донгл, насколько помню, хотя сейчас вот нагуглил что в некоторых случаях и прямого кабеля достаточно).