Винды это единая политика продвижения и большие деньги, потому и популярна.
Что касается Linux`a, то обезьяничать не надо было в свое время не было столько проблем.
Зависимости, библиотеки и прочее решается просто. Одна программа один каталог, где лежат все библиотеки, которые этой программе нужны, места много занимает да и фиг с ним. В результате скачал, откромпилировал - работай, захотел удалить - стер каталог, все. Это позволит работать на любом дистрибутиве, более того это позволит сократить время настроек и зоопарк репозиториев.
И еще момент подход, описанный выше, позволит оптимизировать деятельность разработчиков в том числе по оптимизации ПО.
Флеш видео это вообще каменный век, флеш игрушки - это жесть, когда игрушка из "вконтакте" требует ресурсов больше, чем Серьезный Сэм, то это маразм чистой воды.