Сама система устанавливается только один раз, корень представляет из себя все кроме /usr, /var, /opt, /boot, /home; как ранее говорили можно считать этот раздел read-only, весит он на порядок меньше чем /usr у рядового пользователя, а также в / меньше всего пишут, что в совокупности дает н-ный процент надежности. Более того в /usr сейчас лежат бинарники и библиотеки, которые нужны только в рабочей среде, но никак не предназначенные для экстренного случая восстановления системы. Те у кого накрывался (в простейшем случае вырубание питалова) хоть раз /usr меня поймут. А у тех у кого реал-тайм бэкапы вообще не парятся где и что лежит. Рядовым пользователям, на которых рассчитана федорка не нужно полагаться на бэкап системы, достаточно бэкапа данных. Но вы забываете, что запуск fsck намного лучше реинсталла всей системы, в предложенном варианте может спасти болванка/флешка с линуксом, а если ее нет под рукой?