Судя по всему главная проблема эклипса по мнению пользователей нетбинс в
том, что это конструктор с плгинами. Но, для меня это большой плюс, люблю подобный софт, так же как фаерфокс с дополнениями. Второе преимущество нетбинс в том, что из коробки держит EJB+JBoss. Так как я только разбираюсь, то не могу сказать как дела тут у эклипса, тестовые проекты создаются просто одной кнопочкой (скачал сборку Eclipse kepler jee и доставил туда JBoss tools, которе сам же джейбос и выпускает...странно будет если эти тулзы будут плохими :)). Но, зато я в эклипсе плагины по конструирвоанию регулярок пользую, по доступу не только к томкат но и другим серверам (куча их там), по доступу к БД для редактирования и просмотра...и еще килограмм плагинов :) Плюс еще пишу на андроид (родной гугл плагин) и иногда, теперь уже совсем редко, на С/С++.

В общем нетбинс в ваших описаниях не впечатлил, останусь на эклипсе...я нетбинс поковырял немного, не понравилось, но, понравилось то, что примеры приложений есть, это да, это правильно, мне бы помогло так как изучаю сейчас EJB, но в книге примеры и так есть.
В общем спасибо за инфу.