Комментарии под новостями формируются в потоке, без учёта состояния прошлых и будущих строк. Блочный элемент "code" требует анализа закрывающего тега и его автозакрытия, если он пропущен. Без этого легко одним комментарием поломать всю разметку. Как решить проблему без заметных усложнений логики или переделки я не придумал.

Так как случаи с code в мелких комментариях единичные, то пока всё остаётся как есть, но с небольшим хаком - теги code и /code стали заменяться на переводы строки, т.е. их содержимое не смешивается с текстом, а отделяется. Насколько я заметил, в несворачиваемых мелких комментариях часто в блок code помещается лишь одна строка и в этом случае отделение выглядит органично.

Ещё есть вариант всегда сворачивать все комментарии с code, но пока остановился на отделении отступами.