>Как в PHP перенаправить стандарный вывод в какую-нибудь переменную или хотя-бы в
>файл.

$ ./index.php > /dev/null

;) Если серьезно - то никак. Лучше проектировать скрипт таким образом, что он готовит весь документ в виде строки, а потом выплевывает ее в поток/файл/базу по желанию.