Ух ты...
Большое спасибо за такое участие, но вопрос изначально был про использование стандартных средств. Дописать в конец, конечно можно, но это совсем негибко, поэтому рассматриволось как крайняя мера. А про секции и elf - раскрою секрет)) - дело в том, что целевая платформа совсем не pc. Я пишу программу для avr, соответственно использую кросскомпилятор avr-gcc и все, что в комплекте с ним, но пишу все это под виндой. И хочу получить не совсем бинарник, а hex файл в интеловском формате.
Наверное придется написать для этого маленькую програмку, прилепить ее в местный bin и пускать из Makefile