> вынес вперед тапками 2 модуля
> mod_copy и mod_site_misc.
> на FreeBSD в портах убираете в Makefile в модулях
> mod_copy
> в pkg-plist убираете mod_copy и mod_site_misc
> сначала deinstall потом заново поставить. проверил - проблем нету

так оно и так не подвержено, нахрена эти телодвижения? модуль собирается, но не вкомпилен и не подключен по умолчанию:

#  find /usr/local/ -name 'mod_cop*'
/usr/local/libexec/proftpd/mod_copy.a
/usr/local/libexec/proftpd/mod_copy.so

# proftpd -l
Compiled-in modules:
  mod_core.c
  mod_xfer.c
  mod_auth_unix.c
  mod_auth_file.c
  mod_auth.c
  mod_ls.c
  mod_log.c
  mod_site.c
  mod_delay.c
  mod_facts.c
  mod_dso.c
  mod_ident.c
  mod_auth_pam.c
  mod_ctrls.c
  mod_lang.c

Escape character is '^]'.
220 ProFTPD 1.3.4d Server (ProFTPD Default Installation) [***]
site cpfr /etc/passwd
500 'SITE CPFR' not understood
help
214-The following commands are recognized (* =>'s unimplemented):
CWD     XCWD    CDUP    XCUP    SMNT*   QUIT    PORT    PASV    
EPRT    EPSV    ALLO*   RNFR    RNTO    DELE    MDTM    RMD    
XRMD    MKD     XMKD    PWD     XPWD    SIZE    SYST    HELP    
NOOP    FEAT    OPTS    AUTH*   CCC*    CONF*   ENC*    MIC*    
PBSZ*   PROT*   TYPE    STRU    MODE    RETR    STOR    STOU    
APPE    REST    ABOR    USER    PASS    ACCT*   REIN*   LIST    
NLST    STAT    SITE    MLSD    MLST    
214 Direct comments to root@***
quit
221 Goodbye.
Connection closed by foreign host.