> А у вас оперативка не сыпется и проц не глючит? А то
> оно как-то вот так и бывает. Exfat простой, ему может просто
> не удаваться прогреть систему до критичных значений.

Файловая система? Прогреть устройство? Не думаю...
Память тестил многократно. Устройства и нутрянка в них разные.

Проблема очевидно была давно, я таскал данные на внешнем винте с десктопа на свой ноут и на рабочий ноут. И копировал изменённые файлы при помощи BeyondCompare. Там есть быстрый способ по датам изменений и размеру. Было очень удобненько!

И я не знал бед, пока не решил это дело автоматизировать с помощью Syncthing. И тогда-то я узнал, что у меня горы файлов, которые реально отличаются на пару-тройку байт в конце и которые я давно не трогал и точно не менял. Например, папка с видеозаписью в формате DVD, скопированная на винт.
Примечательно, что бьются не рандомные файлы, а именно конкретные файлы. Та же многострадальная запись с DVD до перехода на ExFAT постоянно билась, благо был DVD под рукой с оригиналом. Я уже считал контрольные суммы видосов и проверял их периодически... Они были как магнит для этого косяка на NTFS. На ExFAT проблема исчезла по мановению волшебной палочки, лежит себе целенькое.

Я с тех пор стал периодически прогонять побайтовое сравнение с бэкапом и внешним винтом в том же Beyond Compare и заметил, что эта проблема только с NTFS. Винил драйвер линукса от Tuxera. Потому что он реально стрёмный.
Если в нём скопировать картинку с тегами на другой раздел, картинка становится меньше весом. И хотя содержит те же графические данные, имеет обрезанные теги.
А ещё он не открывает битые картинки с ntfs к просмотру с ошибкой Stream Read Error. Короче, он себе не доверяет и проверяет данные, которые считывает на соответствие по mime (службе определения формата файла в Linux) и открывает/копирует только корректное и только отбросив "лишнее".

Пробовал разные файловые системы для дуалбутного доступа к разделам.
- Btrfs (через WinBTRFS под оффтопиком) - глючное и тормознутое говно, которое теряет доступ к папкам и не имеет нормального инструмента проверки фс на ошибки, кроме считал/записал, скраб провёл. А ещё если на ней держать базы данных, которые изменять иногда - там лютый треш с фрагментацией появляется. Проще все расширения btrfs отключить, но чем оно тогда лучше ext2?

Ext4 через Ext2FSD (и его форк от bosse) неплох, но не излечил старую проблему - при некорректном завершении под оффтопиком (BSOD, выключили свет и т.д.) все изменения теряются. Удалённые файлы буквально восстанавливаются (забитые нулями) после исправления ошибок на разделе, новые файлы сыпятся в Lost&Found и т.д. То есть изменения записываются только при отмонтировании нормальном ручном. Это решается каким-нибудь sync.exe от Руссиновича (не наверняка) или ручным Flush Caches из интерфейса Ext2FSD (наверняка), но это надо делать руками. Что не всегда приемлемо, учитывая что винда иногда крашится, а светом щёлкают.

Пока остановился на ExFAT. Быстрый, нормально везде поддерживается, данные не бьются. Микрософтовская ядерная реализация (с ядра 5.4) так вообще нормально разделы под линем проверяла на ошибки, в самсунговской ядерной реализации (с ядра 5.7) пока ещё не догнала по функционалу, но так же нормально работает. А это то, что нужно. И exFAT надёжнее при глюках, бсодах и щёлканьем светом, чем ntfs - это факт. Единственное, не хватает симлинков и профиль браузера на нём уже не подержишь. Ну и сжатия не хватает, но реже уже.