Ггг, ну это вы на 13 не заехали просто в прошлом январе, там Мак Кузик чего то недокоммитил и fsck коряво отрабатывал, правда после письма с репортом в рассылку исправил моментально.

Насчёт места - не стоит забывать что там есть резервирование, по дефолту 8% и доступное место всегда меньше реальной ёмкости.
Ещё у меня везде журналирование выключено, чтобы fsck каждый раз реально всю ФС проверял, на больших механических дисках это долго, зато это убрало все поздемные стуки, которые возникали 1-2 раза.
Те когда журнал включён то не факт что он валиден, и у меня был один случай когда система нормально загружалась, работала и минут через 5-10 паниковала. Я поменял вообще всё железо, пересобрал систему и не помогало. Тогда я fsck ещё раз запустил и о чудо на якобы отчеканном диске нашлись ошибки. И потом ещё ни один раз у меня так ошибки при ручном fsck находились после того как автоматический по журналу проверил и ничего не нашёл.
В итоге у меня только softupdates включены со всех фич доступных из tunefs.