> Как быть людям, у которых более трёх раскладок.

больше трёх - это сколько? Возможные варианты:
1. Caps - наиболее частая раскладка (английская), Shift+Caps - следующая раскладка (для небольшого числа раскладок подойдёт)
2. Caps+~ - наиболее частая раскладка (английская), Caps+1, Caps+1...Caps+0 - 10 дополнительных раскладок.

Но для этого, вероятно, придётся пошаманить с xkeyboard-config, и последний вариант я не уверен, что возможен.

По своему опыту могу сказать, что (для меня как пользователя с двумя раскладками) vim-style правило "по умолчанию всегда английская раскладка, и только когда нужно переключаемся на русскую а потом сразу обратно, и текущая раскладка одна для всех окон" - идеальное правило, до которого я дошёл сам. Очень удобно. И нет такого, что переключаешься в другое окно, и, пока не напишешь несколько букв, не поймёшь, какая в нём раскладка.

P.S. Я другой аноним.