> на понятном всем (админам) Shell написан

Задачи нужно решать на своих уровнях, а не каждый раз с нуля. К примеру, в никсоси решена проблема "установки абстрактного, любого шелл-скрипта": https://github.com/NixOS/nixpkgs/blob/46872026bdb05e1487923f... - заметь, что помимо всего прочего над твоим скриптом выполняется dry run и shellcheck, а к нему еще и присобачивается set -o errexit и прочие вещи; в PKGBUILD оппонента ничего из этого нет, просто голый install. Если в будущем появится новый инструмент для проверки скриптов, то его добавят в writeShellApplication, что применит его ко всем одиночным скриптам сразу.

> нулевыми гарантиями работоспособности

Если бы ты хоть как-то вплотную взаимодействовал с дистрами, то увидел бы, что мейнтейнеры обращают внимание на свои патчи только в моменты, когда они отваливаются. Во всем остальном делается тупой rpmdev-bumpspec и сразу же тестовая сборка. Здесь это хотя бы автоматизировано.

> устранит конфликт слияния руками в скриптах сборки и будет уверен, что ничего не сломалось

То есть по-твоему в никсоси конфликты просто глушатся? Нет, выдается лог с ошибками применения патча, лол.

> надо по гигантскому файлу что-то искать?

Почему по гигантскому, я привел выдержку из своего 50-строчного git.nix, в котором собраны все мои предпочтения по гиту: алиасы, кастомные команды, дополнительные системные пакеты и т.д. Ни в каком дистре ты не сможешь все эти связные вещи объединить в один файл (ну ладно, сможешь, если оформишь самораспаковывающийся .run-файл, который положит куда надо конфиги, распакует PKGBUILD со скриптами, соберет и установит его, лол).

> вычисляются при каждой "пересборке" одного единственного

Откровенное вранье, ибо в nix все вычисляется лениво. Подгружается в память - да, вычисляется - нет. Да и выполняется у меня nixos-rebuild switch от силы секунд 5 ("за вычетом времени сборки ПО"), так что твоя проблема надумана.