> Есть же tree model парсеры такие как org.json.JSONObject, com.google.gson.JsonObject которые не могут маппинг сделать.

Надо же. Ну, окей, это видимо тоже парсеры, но с иным внутренним представлением.
Правда, я может не понимаю чего: а какой смысл в этих парсерах? Где их область применения?

Единственное, что приходит в голову -- это удосбство маршаллинга, когда ты хочешь сохранить порядок следования элементов, однако сделано это будет за счёт накладных расходов при работе со сгенерированным объектом. Я затрудняюсь сказать, когда это могло бы быть нужно.