Конечно, в большинстве сущностей нет смысла, если ты их не понимаешь. И в большинстве правил нет смысла, если ты их не соблюдаешь.

Разработчики Fedora не понимают, зачем сделано это деление бинарников, а потому и не придерживаются правил - куда и какой бинарник нужно класть. Они ведут себя, как слон в посудной лавке, ломают всю систему деления бинарников, а теперь оглядываются и говорят: "блин, да тут и так всё побито, давайте остатки посуды разобъём, чтобы всё было единообразно".

В /bin размещаются утилиты, которые необходимы для загрузки системы или для её восстановления. В /sbin располагаются те из предыдущих инструментов, для использования которых нужно быть пользователем root. В /usr/bin размещаются программы, которые используются в штатном режиме работы, когда всё исправно. В /usr/sbin располагаются программы, которые используются в штатном режиме работы, но для использования которых нужно быть пользователем root.

Примеры:

/bin - ls, cat, vi, dd, ping - необходимы при восстановлении системы, но права root не требуются.

/sbin - fsck, mount, umount, ifconfig, arp, fdisk - необходимы для восстановления системы, но требуются права root (или можно пользоваться и с правами обычного пользователя, но только в режиме просмотра).

/usr/bin - cal, audacious, mplayer, firefos - используются в штатном режиме работы, но права root не требуются.

/usr/sbin - dhcpd, postfix, squid - используются в штатном режиме работы, но требуются права root.

В прежние времена /usr можно было смонтировать по NFS и нормально работать, а в случае если /usr не смонтировался, можно спокойно исправить настройки сети, переразбить диски и т.п.

Смысла в делении bin/sbin особого нет, т.к. часто граница между этими программами бывает сложно различимой. Но такое деление очень удобно для автодополнения - у обычного пользователя в автодополнении не будут предлагаться те программы, которыми он _скорее всего_ не пользуется. Но если они ему понадобятся, он может либо исправить свой PATH, либо попробовать ввести команду, дополнив её каталогом /sbin или /usr/sbin.

А ещё, он может написать свои скрипты на shell или собрать простые программы только для себя, положить их себе в /home/user/bin и прописать их в свой PATH - они будут использоваться в автодополнении наравне с системными.

Это деление вполне разумно и его стоит придерживаться, а не объявлять его бессмысленным только потому, что ты его не придерживаешься.