>[оверквотинг удален]
>
>в котором говорится, что есть "шифрование/серитификаты"
>
>А, теперь вопрос как создать такой сертификат?
>Обычно я использую такой набор команд:
>openssl genrsa -des3 -out server.key 1024
>openssl req -new -key server.key -out server.csr
>
>Но, при таком раскладе при заходе на сайте отображается окно, о то,
>что пользователь подтверждает сертификат.

Дело в том, что у Джунипера сертификат выданный авторизованным центром сертификации, к-й в Firefox/Opera прописан как доверенный, потому окно не показывается. Во втором случае используется скорее всего самоподписной сертификат, проверить его подлинность невозможно - вот и появляется окно. Чтоб вам такое же сделать, Вам нужно:
1. Сгенерировать запрос на сертификат
2. Отослать этот запрос в один из центров сертификатов
3. Оплатить сертификат
4. Установить новый сертификат