В статье "Rolling your own Debian packages " (часть 1, часть 2) показано как правильно устанавливать под Debian GNU/Linux программы из исходных текстов, предварительно создав .deb пакет.

В заметке "RPM Rollback in Fedora Core 4/5" описано как настроить yum и rpm в Fedora Core 4/5 для использования функциональности отката системы в прежнее состояние (подобие транзации), после каких-либо манипуляций с пакетами.

Например: