> Механизм? Не знаю. Но, скажем, часть клеток будут заражены синтезированными препаратами, и какие последствия для организма сказать точно нельзя. Может быть, это резко ослабит защиту от чего-нибудь ещё, и повлияет на неё в долгосрочной перспективе. И, положим, более чем вероятно, что половые клетки могут пострадать.

Если бы подобные эффекты от вакцин были возможны, о них бы уже знали. Все таки технологии не новые (векторным вакцинам кажется 50+ лет, мРНК - лет 2). Можете за деталями обратится к замечательной подборке на сайте CDC о безопасности вакцин в целом.
Если хочется чего попроще - послушайте что биологи рассказывали про вакцины, очень познавательно. Благо сейчас много университетов записи лекций публикуют, да и научно-популярные лекции были.

> Если я верно помню, организм вырабатывает антитела на белки, которыми вирус цепляется и проникает в клетку, и код этих белков у таких вирусов циклически модифицируется, из-за чего иммунитет в итоге знает о прошлой итерации, с которой он уже встречался, но не о нынешней. Там тысячи возможных комбинаций.

Вирус это не какой-то там инженер, а эволюция у крупных вирусов (к которым относится ковид) идет относительно медленно, так что вероятность того что он изменится так, что его иммунитет не сможет распознать - в рамках 1 года низкая (что мы сейчас и видим), в рамках 2-х лет становится немного более значительной, но на этот случай ученые могут следить за штаммами (что и делают сейчас) и разрабатывать бустеры если увидят достаточно изменений в тех белках, по которым сейчас идет идентификация.

> на основе аденовируса раз в 20 лет или типа того.

В мире преобладают мРНК-вакцины от ковида, у них этой проблемы нет. А для аденовирусных - ты получаешь иммунитет к конкретному носителю, это да, но вариантов вирусов намного больше двух.