Этим должен заниматься DE, а не каждое приложение отдельно.
И, не поверишь, у пользователей тайлинговых WM такая проблема не стоит. Ни в иксах, ни в wayland.

Это кстати, отдельно бесило, когда перетыкаешь монитор — а приложение не видать, потому что оно пытается появиться хреф знает где. Или подвнядой, когда малварь в цикле перебирает окна с заголовками популярных антивирусов и сдвигает их за экран. Тупо, но работает и не требует никаких специальных прав.

Повторюсь: клиентское приложение не должно манипулировать окнами. Даже своими. Никак. Вообще никак. От слова «совсем». И пытаться пропихнуть кривые костыли, нарушающие этот принцип — это либо от глупости, либо прямой саботаж. Если где-то остались уродливые приложения, завязанные на манипуляцию окнами — это их надо переписывать, а не протоколы костылить.